新圍污水處理廠改善工程的設計和建造工程於2016年5月展開，2021年3月完成及啟用，審計署發表新一份審計報告，就渠務署在管理新圍污水處理廠的改善工程和營運方面進行審查。
審計署發現，經改善的污水處理廠不同地方兩度出現滲漏和積水，期間承辦商重複執修仍未能解決所有問題，其至影響日常營運，並可能構成安全風險。
審計署指出，合約訂有一套共14項關鍵績效指標，衡量承辦商在營運污水處理廠表現。承辦商所收取的每月營運費用會因應其表現水平而調整。
經改善的新圍污水處理廠自2021年3月啟用至去年10月為止，渠務署從支付給承辦商A的營運費用中，合共扣減了7.8萬多元，涉及11次未能符合3項有關合約管理及呈報的關鍵績效指標。
報告亦發現污水廠排放水樣本受污染，在啟用首7個月期間，曾4次發現5天生化需氧量濃度異常偏高的情況，但最終發現取樣瓶、自動取樣機部件和取樣工具受污染。
審計署認為，渠務署需要持續檢討經改善的新圍污水處理廠收集和處理排放水樣本的新措施的成效。
