衞生防護中心轄下的疫苗可預防疾病科學委員會經檢視科學證據、本地數據和海外經驗後，留意到本地季節性流感活躍程度自2020年2月中以來一直處於低水平，流感的傳播可能因一系列應對新型冠狀病毒病實施的非藥物干預公共衞生措施，以及旅遊和出入境限制而改變。
然而，當放寬這些防控措施後，流感的傳播可能會增加，因而進一步導致流感與嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒共同流行的可能性，對體弱人群和醫療系統構成額外負擔。
日益增加的證據顯示，同時感染新型冠狀病毒病和流感會增加嚴重併發症和死亡率，而接種流感疫苗可減少住院的可能性和縮短住院期。基於流感疫苗對患者的保護，而健康人士亦可能在患上季節性流感後出現嚴重病症，因此，除了已知對疫苗有禁忌症的人士外，所有市民每年都應接種季節性流感疫苗，以保障個人健康。
科學委員會建議優先接種季節性流感疫苗的群組與上一季節相同，認為感染新型冠狀病毒病和流感的高危群組類同，因此確保感染流感風險較高的人士(例如醫護人員、長者、兒童和孕婦)優先接種流感疫苗至為重要。另一方面，科學委員會認為，在知情同意下，為方便行政安排和提高接種率，可作出彈性處理，於同一到訪期間為市民接種新冠疫苗和季節性流感疫苗。同一原則亦適用於院舍等類似場所。
