「港區國安法」草案摘要提及行政長官應當指定若干法官，負責處理危害國家安全犯罪案件，香港律師會認為，相關決定將賦予行政長官監察及影響司法機構的權力，損害司法獨立。
律師會發表聲明指出，以往的慣例是行政長官在委任法官和司法人員時，根據司法人員推薦委員會的建議行事，認為「港區國安法」應依循相關慣例。
對於草案提及內地當局在「特定情形」下對國家安全案件行使管轄權，律師會希望當局盡快澄清，表示關注基本人權，包括公平審訊權，是否可得到妥善保障。
律師會又表示，如果當局在立法過程中能夠諮詢各持分者，相信可增加公眾的信心，以及確保「港區國安法」會按普通法原則引入和制定，並符合「一國兩制」的方針。
