海南海事提出，推進建立國際船舶登記制度，研究制定海南自由貿易港海員管理制度，構建與自貿港相適應的口岸管理模式，建立國際航行船舶綜合質量管理制度，打造海南自貿港海事特區。
海南海事局副局長鄂海亮在一研討會發言表示，海南海事積極組織起草規定，指導籌備海南自貿港國際船舶登記中心 ，推進立法工作，落實「中國洋浦港」船籍港政策，着力優化海事營商環境，為海南自貿港建設保駕護航。
交通運輸部水運局副局長易繼勇表示，下一步，水運局將從積極推進瓊州海峽港航一體化發展；創新郵輪、遊艇管理政策，推動海南郵輪遊艇產業發展；推動相關財稅政策盡快落地；加強內地與海南自貿港間運輸、通關便利化；創新港口、航運管理體制機制；深化「放管服」 改革等七方面支持推進海南自貿港建設。
交通運輸部總工程師姜明寶稱，正在制定與海南自貿港相關的交通運輸實施方案，以不斷創新完善政策舉措，讓制度集成創新發揮更大作用。
