澳門計劃把目前的健康碼由電腦版本轉為手機應用程式，增加行程紀錄功能。
有關的運作方式是透過掃碼紀錄市民行程，資料只會儲存在市民的手機內。當市民要生成健康碼時，中央系統會將政府列為疫點的地方，與市民手機內的資料做對比，然後生成健康碼的三種顏色分級。
當局表示，新系統是為配合目前要求市民出示健康碼進入特定場所，但是否強制執行掃描行程，暫時未有討論，會視乎疫情的變化，當局會在系統完成後再公布。
澳門目前已要求進入餐廳堂食，出示綠色健康碼。乘搭公共交通工具時，司機有權要求乘搭的人士出示綠色健康碼。
另外，為配合將出入境的人數分流到橫琴口岸，澳門當局在橫琴增設臨時新冠病毒核酸檢測站，收費下調至每次70元。
