港鐵宣布，關閉九龍站；而青衣站及沙田站已經關閉。
港鐵早前表示，因為特別事故，東涌線來回列車不停青衣站，車站關閉；由於有人破壞車站設施，東鐵線來回方向列車亦不停沙田站，沙田站暫時關閉。
另外，港鐵一列往東涌的列車接近下午5時在南昌站上落客期間，有人非法闖入車尾駕駛室，將車尾的緊急落客斜道放下到路軌上，令列車未能繼續行程，東涌線列車服務受阻。港鐵職員需要收回斜道，並搜索確定是否有人闖入路軌，以及檢查鐵路設施。
港鐵東涌線服務一度受阻，但於5時42分逐步回復正常。
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