有報道指出，高鐵香港段西九龍總站連接隧道(南)的地面有積水，旁邊牆身亦有滲水，港鐵回覆查詢時表示，相關水漬或輕微滲水，屬於工程規範要求及標準上容許出現的狀況，並沒有影響隧道及車站結構安全，亦沒有影響車站機電設施及試營運工作。
港鐵強調，連續牆的土木結構符合地下水防滲要求，設計和建造安排上已盡量防止地下水滲入，但在工程技術上，難以達致完全防水，地下水有可能由泥石層透過連續牆接縫滲出，情況並不罕見，可透過灌漿及其他防漏施工處理。
港鐵表示，西九龍總站的地下連續牆均設有排水系統，會繼續監測地底結構情況及進行定期檢查及保養。
